Studio One側で保存を実行する場合は、Studio One側に何かしら編集を行ったという情報を送る必要がございます。
Piapro Studio プラグインは特殊な仕様のVST / AUプラグインとなっているため、Piapro Studio プラグイン上のみの編集だけでは、Studio Oneに編集されたという情報が送られません。Piapro Studio プラグインでの作業を終えてウィンドウを閉じる際は、必ずStudio Oneにも編集の情報を送ってから保存を実行してください。

Studio Oneの場合はプラグインウィンドウを閉じる開くという操作だけでも編集されたことになります。

もし保存が正常に実行できているか心配な場合は、「ファイル」メニューの「別名で保存」から保存してください。